Wydawnictwo Naukowe FNCE oraz Grupa Wydawnicza FNCE rozwijają współpracę wydawniczą z Muzeum Początków Państwa Polskiego w Gnieźnie. Jej efektem są publikacje związane z działalnością naukową, badawczą i edukacyjną Muzeum, przygotowywane z udziałem badaczy reprezentujących różne dyscypliny nauk humanistycznych.
Jednym z przedsięwzięć realizowanych w ramach tej współpracy jest dwutomowa monografia „Bolesław Chrobry. Człowiek i dzieło” pod redakcją Dariusza Andrzeja Sikorskiego i Eweliny Siemianowskiej. Publikacja została przygotowana w związku z tysiącleciem pierwszej koronacji królewskiej w Polsce i gromadzi studia poświęcone Bolesławowi Chrobremu, jego rodzinie i otoczeniu dynastycznemu, organizacji państwa wczesnopiastowskiego oraz relacjom z sąsiadami.

Drugim przykładem współpracy jest monografia „Wielka Lechia – wielka ściema” autorstwa Eweliny Siemianowskiej, Dariusza Stryniaka, Artura Wójcika i Marcina Wieczorka. Książka jest rezultatem projektu badawczo-edukacyjnego Muzeum i z perspektywy kilku dyscyplin analizuje fenomen współczesnych narracji pseudonaukowych dotyczących rzekomej Wielkiej Lechii, konfrontując je z wynikami badań naukowych.

Współpraca Muzeum Początków Państwa Polskiego w Gnieźnie, Wydawnictwa Naukowego FNCE oraz Grupy Wydawniczej FNCE pozwala łączyć zaplecze merytoryczne i projekty naukowe Muzeum z działalnością wydawniczą oraz profesjonalną realizacją procesu publikacyjnego. Jej efektem są nowe monografie poświęcone historii, archeologii i dziedzictwu początków państwa polskiego, a także publikacje podejmujące współczesne problemy związane z interpretacją i popularyzacją przeszłości.